朱佑樘大怒，而日本国主足利义合派遣使臣入京，称本土并不知情，已经派遣使臣呵斥昆仑洲日军。
是月，朱佑樘身体不豫……
弘治二十五年正月初三，朱佑樘感到时日无多，召朱厚照入养心殿，传大位于朱厚照。
正月初六，朱佑樘病卒养心殿内，享年六十八……